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基因突變在沒有外界環境的影響的情況下是可以自發發生的，如果有外界環境的影響，則基因突變發生的頻率會增加，引起基因突變的外界原因包括：
紫外線：形成嘧啶二聚體，使轉錄終止，復制受阻。
電離輻射：αβγX-射線等，主要通過電離作用造成損傷?？稍斐啥喾N損傷，如DNA斷裂、堿基脫落、雜環破裂、氧化等。
2. 化學因素
烷化劑：有活潑烷基，可轉移到堿基或磷酸上，如硫酸二甲酯、芥子氣等。鳥嘌呤的O6和N7Z易烷化，導致錯配(GT)或脫落。磷酸三酯不穩定，易斷裂。雙功能試劑可造成交聯。
堿基或核苷類似物：FU、BrdU、6-巰基嘌呤等?？筛偁幰种坪塑账岷铣苫驌饺牒怂釋е洛e配。
亞硝酸鹽及亞硝胺：前者造成脫氨，后者氧化后生成烷化劑和自由基。
代謝活化化合物：如苯并笓、黃曲霉毒素等。經混合功能氧化酶催化形成環氧化物，與核酸結合，造成突變。以上物理及化學因素統稱誘變劑。
3. 生物因素
DNA、RNA腫瘤病毒可插入基因組，引起突變。
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