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10x Genomics植物單細胞文章集錦

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10x Genomics植物單細胞文章集錦

發布日期:2021-07-23 作者: 點擊:

  單細胞測序技術已然是當下的研究熱點,之前所有的Total RNA測序的樣本,都可以用來做單細胞測序,以更高的分辨率解析動植物的分子機制,助力科研工作者們更加高效,快速的取得好的實驗成果,發表高分文章。換句話說,單細胞測序的時代已經到來,您準備好了嗎?


  10x Genomics作為單細胞測序領域的領頭羊,不斷致力于單細胞測序技術的優化和新應用的開發,連年上榜The Scientist Top10,強力推動單細胞測序時代的快速發展。目前10x Genomics已經助力全球客戶發表了2100+篇高分文章,其中大部分是集中在人類健康方面的研究。但是,近兩年來,單細胞測序在植物上的應用也嶄露頭角。接下來小編整理了一些利用10x Genomics平臺已經發表的植物單細胞測序文章,希望對研究植物的老師有所啟發。


  單細胞RNA測序(scRNA-seq)已廣泛應用于動物細胞異質性的研究,但尚未廣泛應用于植物的相關研究,本文是全球首篇植物高通量單細胞測序文章。本研究利用10x Genomics的單細胞測序平臺,從擬南芥(Arabidopsis thaliana)根細胞的原生質體中獲得7552個單細胞轉錄組。作者利用86個已知的根組織細胞特異性maker基因在轉錄組中的表達情況劃分為9個單細胞類群,發現無論是主要的根組織類群,還是特定組織中的特異細胞類型都能在這9個類群中被有效檢測到。此外,進一步鑒定出不同的亞群和稀有細胞類型,包括假定的靜止中心細胞。對根表皮細胞轉錄組的擬時序分析,定義了根毛和非毛細胞分化發育軌跡。此外,對根表皮突變進行單細胞轉錄組測序,以單細胞分辨率對rhd6(根毛細胞缺陷)和gl2(非毛細胞缺陷)兩種突變體的根組織基因表達進行比較分析,并為突變基因的影響提供了前所未有的視角??傮w而言,這項研究證明了scRNA-seq在植物中的可行性和實用性,并以單細胞分辨率提供了擬南芥根的首張基因表達圖譜。

本文網址:http://www.oyuncash.com/news/601.html

關鍵詞:10xGenomics,10×Genomics單細胞

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