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腫瘤研究技術|癌癥與蛋白組

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腫瘤研究技術|癌癥與蛋白組

發布日期:2021-09-10 作者: 點擊:

蛋白質組學(Proteomics)是研究在特定時間或環境下某個細胞或某種組織的基因組表達的全部蛋白質。蛋白質組學旨在列出全部蛋白質的細目,弄清每一個蛋白質的結構和功能及蛋白質群體內的相互作用,對比在疾病和健康狀態下它們的表達水平的變化。

蛋白質作為基因功能的首要執行者,在腫瘤研究中及其重要。它既在腫瘤產生和發展的過程中起著重要作用,又在很大程度上決定正常細胞和腫瘤細胞之間的差異。

01
腫瘤早期診斷

應用蛋白組學相關技術分析體液(如血清、唾液和乳頭抽取液等),尋找特異的腫瘤標志物并建立腫瘤高危人群篩選工具,是蛋白質組學在臨床腫瘤研究中應用的主要方面之一。Alexander等對10例健康個體和10例乳腺癌患者乳頭抽取液也進行了蛋白質組學分析,發現了兩種差異表達的蛋白質:GCDFP-15AAG,這表明乳腺分泌物檢測對乳腺癌早期診斷中可能具有重要意義。


02

腫瘤分型分期

原發腫瘤蛋白譜分析將為腫瘤分型、分級和分期提供重要依據,基于質譜分析的腫瘤分型將較傳統的病例分型更為可靠。Ahmed等對具高轉移性的結腸癌細胞系HCT116研究發現,血漿尿激酶型溶酶原激活劑(uPA)及其受體(uPAR)在腫瘤轉移過程中發生丟失,提示uPA和uPAR可能是造成結直腸癌進展或轉移的重要因素。


03

腫瘤預后判斷

Jacquemier等通過組織芯片證實檢測26種蛋白對判斷乳腺癌的預后有重要意義。Yanagisawa等將病理改變、影像學表現和臨床癥狀無明顯差異的NSCLC患者,基于組織標本中15蛋白表達差異,通過MALDI技術將其分為預后差組和預后良好組,其中,預后差組患者中位生存期只有6個月,而預后良好者卻達到了33個月(p<0.0001)。


04

腫瘤治療新靶點

蛋白質組學在藥物作用靶點的發現和篩選模型的建立上,有其獨到的優越性。在尋找藥物和作用靶點時,可將一個細胞或組織的健康和疾病狀態的蛋白質組圖譜進行比較,找出差異蛋白質。


隨著技術的發展,臨床重要樣本應用蛋白質組學找尋腫瘤標志物的報道越來越多,通過蛋白質組學技術,有望發現與腫瘤病理相關的特異性蛋白質,進而發現可以與藥物結合并能決定腫瘤細胞活性的關鍵部位,進而可以為腫瘤的研究診斷和制藥方面提供有效的靶蛋白。

蛋白質組學技術介紹
01
蛋白質全譜分析

對蛋白質進行全局定性分析,判斷蛋白有無,并有效提高鑒定低豐度蛋白的可行性。

對腫瘤樣本進行蛋白質全譜分析,初步了解腫瘤樣本中蛋白質表達情況。


02
定量蛋白質組

定量蛋白質組(TMT/iTRAQ定量蛋白組分析、Label free 蛋白質分析、DIA蛋白組分析和PRM靶向蛋白組分析)TMT/iTRAQ定量蛋白組分析:對樣本進行同位素標記,Z多可同時檢測16個不同樣本。

腫瘤樣本通過不同方法進行蛋白質鑒定,實現腫瘤多樣本之間蛋白的相對定量。


03
修飾蛋白質組

修飾蛋白質組(磷酸化定量蛋白質組、乙?;揎椀鞍踪|組、泛素化修飾蛋白質組、糖基化修飾蛋白質組、甲基化修飾蛋白質組、乳酸化修飾蛋白質組)

探究腫瘤樣本蛋白質翻譯后修飾產生的變化,鑒定藥物作用靶點、篩選臨床標志物。



END


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本文網址:http://www.oyuncash.com/news/612.html

關鍵詞:蛋白組,腫瘤,生物標志物

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