武漢愛基百客生物科技有限公司
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新一代高通量測序技術和高性能的生物信息分析實現了表達譜分析的數字化、高效性,能夠全面、快速地定量檢測物種特定組織或發育時期的基因表達種類和豐度信息。
技術原理
數字基因表達譜(DGE)測序指直接對某一物種或特定細胞在特定功能狀態下產生的mRNA進行高通量測序,研究基因的表達差異情況,已被廣泛應用于基礎科學研究、疾病機理、生物標記和藥物研發等領域。
技術流程
分析流程
技術優勢
1. 數字化信號:直接測定每個基因的特異表達標簽序列,通過計數表達標簽序列的數目來確定該基因的表達量,大大提高了定量分析的準確度;
2. 可重復性高:不同批次的表達譜度量準確,能夠更準確的進行表達差異分析;
3. 高靈敏度:對于表達存在差異的基因能夠靈敏的檢測其表達差異,能夠檢測出低豐度的表達基因;
4. 高通量:一次測序可得到800萬以上的序列;
5. 高準確性:使用RPKM方法計算基因表達量,消除基因長度和測序量差異對計算基因表達的影響確?;虮磉_量計算的高準確性
樣品要求
1. 樣品類型:總RNA;
2. 樣品濃度:≥250 ng/ul;
3. 樣品總量:>20ug;(不包括樣品檢測損耗);
4. 樣品純度:OD260/280為1.8~2.2,OD260/230≥1.0,260nm處有正常峰值;
5. RNA完整性: 電泳檢測28S/18S≥1.5。(距送樣日近期的電泳結果)。
測序方案
1. 測序平臺:BGI 500;
2. 測序類型:單端測序,SE50;
3. 測序數據量:大于10M tag。
結果展示
差異基因韋恩圖
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