武漢愛基百客生物科技有限公司
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小RNA主要包含miRNA 、piRNA 、siRNA、snoRNA等RNA分子。小RNA參與基因表達與調控、RNA的加工與剪切、蛋白質翻譯、遺傳“入侵”抑制、配子發生等重要生物學過程,是生命活動中必不可少的調控因子。小RNA中主要組成的是微小RNA(microRNA, 簡稱miRNA),可通過識別靶mRNA 實現轉錄后的基因調控。研究表明, 包括癌癥、心血管疾病、免疫系統疾病在內的多種疾病與miRNA 的調控作用密切相關。
技術原理
小RNA測序通過將18-30 nt范圍的小RNA從總RNA中分離出來,兩端分別加上特定接頭后體外反轉錄做成cDNA再做進一步處理后,利用測序儀對DNA片段進行單向末端直接測序。通過對小RNA大規模測序分析,可以從中獲得物種全基因組水平的小RNA表達信息。
技術流程
分析流程
樣品要求
總RNA≥1.5ug;RNA樣品濃度≥250 ng/ul;
測序平臺策略
BGI平臺;SE50
案例分享
研究利用高通量測序手段研究了CMA(牛奶過敏)中起關鍵調節作用的 miRNA及其靶基因,為CMA發病診斷和治療策略提供了新思路。研究者選取了4-18個月的兒童中獲得的外周血單核細胞:10例CMA患者和11例健康對照者,構建了smallRNA測序文庫。miR-193a-5p可能在IgE介導的CMA中起作用。這個miRNA可能成為兒童時期食物過敏常見形式的一種新的診斷和治療靶點。
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