武漢愛基百客生物科技有限公司
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轉錄組(transcriptome)廣義上指某一生理條件下,細胞內所有轉錄產物的集合,包括信使RNA、核糖體RNA、轉運RNA及非編碼RNA;狹義上指所有mRNA的集合。蛋白質是行使細胞功能的主要承擔者,蛋白質組是細胞功能和狀態的直接描述,轉錄組成為研究基因表達的主要手段,轉錄組是連接基因組遺傳信息與生物功能的蛋白質組的必然紐帶,轉錄水平的調控是目前研究很多的,也是生物體重要的調控方式。
技術原理
提取總RNA反轉錄成為cDNA,再通過新一代高通量測序,能夠全面快速地獲得某一物種特定組織或器官在某一狀態下的幾乎所有轉錄本序列信息,已廣泛應用于基礎研究、臨床診斷和藥物研發等領域。
技術流程:
分析流程
樣品要求
1、 細胞樣本:3 X 10^6~1 X 10^7個
2、 動物組織:1-2g
3、 植物組織:3-4g(100mg左右分裝)
4、 RNA:請提供≥15μg,OD260/280=1.8~2.2,OD260/230≥2.0,濃度≥400ng/μl,28S:18S≥1.0,23S:16S≥1.5;
案例分享
生理和轉錄組測序分析,發現不同光譜的組合更有利于調節馬鈴薯生長。在三個樣品中共發現2220個差異表達基因(DEG),并分析了三個比較組中的DEG。與對照條件相比,在紅光(紅色)和藍光(藍色)條件下分別鑒定出總共1180和984個差異基因表達。在這些DEG中,涉及光合作用的四個基因和涉及色素合成的兩個基因高度表達
文章鏈接:https://dx.doi.org/10.1007/s13205-018-1410-0
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